Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb1Q9D5L7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms