Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zcchc13Q9D548 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Zcchc13Q9D548 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms