Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms