Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms