Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcc1Q9D4H2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms