Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933402D24RikQ9D4D3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933402D24RikQ9D4D3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms