Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pus10Q9D3U0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms