Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Katnal2Q9D3R6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms