Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl53Q9D1H8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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