Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms