Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms