Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc3Q9D114 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Hddc3Q9D114 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hddc3Q9D114 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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