Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrto4Q9D0I8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrto4Q9D0I8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms