Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2e1Q9D0D5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms