Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Utp11Q9CZJ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Utp11Q9CZJ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms