Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms