Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChtopQ9CY57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms