Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cxxc1Q9CWW7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxxc1Q9CWW7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms