Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms