Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2Q9CUU3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms