Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard3bQ9CSB4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard3bQ9CSB4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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