Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkiras2Q9CR56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkiras2Q9CR56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms