Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms