Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifitm3Q9CQW9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms