Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccer1Q9CQL2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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