Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms