Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudt21Q9CQF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms