Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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