Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CQC3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms