Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole4Q9CQ36 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole4Q9CQ36 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms