Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg3Q9CPX6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg3Q9CPX6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms