Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms