Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms