Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim26Q99PN3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms