Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms