Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco2Q99NF1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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