Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms