Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b1Q99NB9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b1Q99NB9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms