Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Brms1Q99N20 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brms1Q99N20 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms