Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd3Q99LY2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms