Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cstf3Q99LI7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms