Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q99KU6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q99KU6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q99KU6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q99KU6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q99KU6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q99KU6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms