Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmp1Q99KU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmp1Q99KU0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms