Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms