Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlgn1Q99K10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn1Q99K10 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms