Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krcc1Q99JT5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms