Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfxn1Q99JR1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfxn1Q99JR1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfxn1Q99JR1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfxn1Q99JR1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfxn1Q99JR1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfxn1Q99JR1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfxn1Q99JR1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms