Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan1Q99J59 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan1Q99J59 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms