Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc33a1Q99J27 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms