Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf112Q96DY5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf112Q96DY5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms